Zniszcz strukturę komórkową

Kaspaza może bezpośrednio zniszczyć strukturę komórki, na przykład rozszczepiając warstwę włókien jądrowych. Warstwa włókien jądrowych (Lamina) jest polimerem połączonym głową z ogonem przez polimeryzację białka warstwy włókien jądrowych, tworząc w ten sposób szkieletową strukturę błony jądrowej, dzięki czemu chromatyna może być utworzona i ułożona normalnie. W procesie apoptozy komórki laminina jako substrat jest rozbijana przez kaspazę w ustalonej pozycji blisko środka, co prowadzi do rozpadu lamininy i kondensacji chromatyny komórkowej.